Program PWSCF v.5.4.0 starts on 4Aug2017 at 0:35:46 This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite for quantum simulation of materials; please cite "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009); URL http://www.quantum-espresso.org", in publications or presentations arising from this work. More details at http://www.quantum-espresso.org/quote Parallel version (MPI & OpenMP), running on 72 processor cores Number of MPI processes: 36 Threads/MPI process: 2 R & G space division: proc/nbgrp/npool/nimage = 36 Waiting for input... Reading input from standard input Current dimensions of program PWSCF are: Max number of different atomic species (ntypx) = 10 Max number of k-points (npk) = 40000 Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) = 3 file Hg.rel-pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF: wavefunction(s) 6S renormalized Subspace diagonalization in iterative solution of the eigenvalue problem: one sub-group per band group will be used scalapack distributed-memory algorithm (size of sub-group: 4* 4 procs) Parallelization info -------------------- sticks: dense smooth PW G-vecs: dense smooth PW Min 181 81 22 12482 3772 537 Max 182 82 23 12488 3806 542 Sum 6539 2951 809 449443 136487 19419 bravais-lattice index = 14 lattice parameter (alat) = 14.1484 a.u. unit-cell volume = 3136.8627 (a.u.)^3 number of atoms/cell = 24 number of atomic types = 3 number of electrons = 180.00 number of Kohn-Sham states= 216 kinetic-energy cutoff = 47.0000 Ry charge density cutoff = 416.0000 Ry convergence threshold = 1.0E-08 mixing beta = 0.7000 number of iterations used = 8 plain mixing Exchange-correlation = PBE ( 1 4 3 4 0 0) Non magnetic calculation with spin-orbit celldm(1)= 14.148378 celldm(2)= 1.036810 celldm(3)= 1.211286 celldm(4)= -0.096332 celldm(5)= -0.318132 celldm(6)= -0.305014 crystal axes: (cart. coord. in units of alat) a(1) = ( 1.000000 0.000000 0.000000 ) a(2) = ( -0.316242 0.987404 0.000000 ) a(3) = ( -0.385349 -0.245942 1.121710 ) reciprocal axes: (cart. coord. in units 2 pi/alat) b(1) = ( 1.000000 0.320276 0.413760 ) b(2) = ( 0.000000 1.012756 0.222054 ) b(3) = ( 0.000000 0.000000 0.891496 ) PseudoPot. # 1 for O read from file: /users/gautes/Pseudo/O.rel-pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF MD5 check sum: e551570ea340e0688630c94d366e26e3 Pseudo is Ultrasoft + core correction, Zval = 6.0 Generated using "atomic" code by A. Dal Corso v.5.0.2 svn rev. 9656 Using radial grid of 1095 points, 6 beta functions with: l(1) = 0 l(2) = 0 l(3) = 1 l(4) = 1 l(5) = 1 l(6) = 1 Q(r) pseudized with 0 coefficients PseudoPot. # 2 for Hg read from file: /users/gautes/Pseudo/Hg.rel-pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF MD5 check sum: a7fd98bfb2640362c6e2ed76594f1960 Pseudo is Ultrasoft + core correction, Zval = 12.0 Generated using "atomic" code by A. Dal Corso v.5.0.2 svn rev. 9656 Using radial grid of 1279 points, 10 beta functions with: l(1) = 0 l(2) = 0 l(3) = 1 l(4) = 1 l(5) = 1 l(6) = 1 l(7) = 2 l(8) = 2 l(9) = 2 l(10) = 2 Q(r) pseudized with 0 coefficients PseudoPot. # 3 for Se read from file: /users/gautes/Pseudo/Se.rel-pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF MD5 check sum: 38611c150961c07dbd63be353364166d Pseudo is Ultrasoft + core correction, Zval = 6.0 Generated using "atomic" code by A. Dal Corso v.5.0.2 svn rev. 9656 Using radial grid of 1211 points, 6 beta functions with: l(1) = 0 l(2) = 0 l(3) = 1 l(4) = 1 l(5) = 1 l(6) = 1 Q(r) pseudized with 0 coefficients atomic species valence mass pseudopotential O 6.00 15.99940 O( 1.00) Hg 12.00 200.59000 Hg( 1.00) Se 6.00 78.96000 Se( 1.00) 2 Sym. Ops., with inversion, found s frac. trans. isym = 1 identity cryst. s( 1) = ( 1 0 0 ) ( 0 1 0 ) ( 0 0 1 ) cart. s( 1) = ( 1.0000000 0.0000000 0.0000000 ) ( 0.0000000 1.0000000 -0.0000000 ) ( 0.0000000 0.0000000 1.0000000 ) isym = 2 inversion cryst. s( 2) = ( -1 0 0 ) ( 0 -1 0 ) ( 0 0 -1 ) cart. s( 2) = ( -1.0000000 -0.0000000 -0.0000000 ) ( 0.0000000 -1.0000000 0.0000000 ) ( 0.0000000 0.0000000 -1.0000000 ) double point group C_i (-1) there are 4 classes and 2 irreducible representations the character table: E -E i -i G_2+ 1.00 -1.00 1.00 -1.00 G_2- 1.00 -1.00 -1.00 1.00 the symmetry operations in each class and the name of the first element: E 1 identity -E -1 identity E i 2 inversion -i -2 inversion E Cartesian axes number of k points= 19 Fermi-Dirac smearing, width (Ry)= 0.0010 cart. coord. in units 2pi/alat k( 1) = ( 0.0000000 0.0000000 0.0000000), wk = 0.0277778 k( 2) = ( 0.0000000 0.0000000 0.2971654), wk = 0.0555556 k( 3) = ( 0.0000000 0.3375855 0.0740179), wk = 0.0555556 k( 4) = ( 0.0000000 0.3375855 0.3711833), wk = 0.0555556 k( 5) = ( 0.0000000 0.3375855 -0.2231475), wk = 0.0555556 k( 6) = ( 0.2500000 0.0800689 0.1034399), wk = 0.0555556 k( 7) = ( 0.2500000 0.0800689 0.4006053), wk = 0.0555556 k( 8) = ( 0.2500000 0.0800689 -0.1937255), wk = 0.0555556 k( 9) = ( 0.2500000 0.4176544 0.1774578), wk = 0.0555556 k( 10) = ( 0.2500000 0.4176544 0.4746232), wk = 0.0555556 k( 11) = ( 0.2500000 0.4176544 -0.1197076), wk = 0.0555556 k( 12) = ( 0.2500000 -0.2575165 0.0294221), wk = 0.0555556 k( 13) = ( 0.2500000 -0.2575165 0.3265875), wk = 0.0555556 k( 14) = ( 0.2500000 -0.2575165 -0.2677433), wk = 0.0555556 k( 15) = ( -0.5000000 -0.1601379 -0.2068799), wk = 0.0277778 k( 16) = ( -0.5000000 -0.1601379 0.0902855), wk = 0.0555556 k( 17) = ( -0.5000000 0.1774476 -0.1328620), wk = 0.0555556 k( 18) = ( -0.5000000 0.1774476 0.1643034), wk = 0.0555556 k( 19) = ( -0.5000000 0.1774476 -0.4300274), wk = 0.0555556 cryst. coord. k( 1) = ( 0.0000000 0.0000000 0.0000000), wk = 0.0277778 k( 2) = ( 0.0000000 0.0000000 0.3333333), wk = 0.0555556 k( 3) = ( 0.0000000 0.3333333 0.0000000), wk = 0.0555556 k( 4) = ( 0.0000000 0.3333333 0.3333333), wk = 0.0555556 k( 5) = ( 0.0000000 0.3333333 -0.3333333), wk = 0.0555556 k( 6) = ( 0.2500000 0.0000000 -0.0000000), wk = 0.0555556 k( 7) = ( 0.2500000 0.0000000 0.3333333), wk = 0.0555556 k( 8) = ( 0.2500000 0.0000000 -0.3333333), wk = 0.0555556 k( 9) = ( 0.2500000 0.3333333 0.0000000), wk = 0.0555556 k( 10) = ( 0.2500000 0.3333333 0.3333333), wk = 0.0555556 k( 11) = ( 0.2500000 0.3333333 -0.3333333), wk = 0.0555556 k( 12) = ( 0.2500000 -0.3333333 -0.0000000), wk = 0.0555556 k( 13) = ( 0.2500000 -0.3333333 0.3333333), wk = 0.0555556 k( 14) = ( 0.2500000 -0.3333333 -0.3333333), wk = 0.0555556 k( 15) = ( -0.5000000 0.0000000 0.0000000), wk = 0.0277778 k( 16) = ( -0.5000000 0.0000000 0.3333333), wk = 0.0555556 k( 17) = ( -0.5000000 0.3333333 0.0000000), wk = 0.0555556 k( 18) = ( -0.5000000 0.3333333 0.3333333), wk = 0.0555556 k( 19) = ( -0.5000000 0.3333333 -0.3333333), wk = 0.0555556 Dense grid: 449443 G-vectors FFT dimensions: ( 96, 96, 120) Smooth grid: 136487 G-vectors FFT dimensions: ( 64, 72, 75) Largest allocated arrays est. size (Mb) dimensions Kohn-Sham Wavefunctions 3.17 Mb ( 962, 216) NL pseudopotentials 3.35 Mb ( 481, 456) Each V/rho on FFT grid 0.56 Mb ( 36864) Each G-vector array 0.10 Mb ( 12485) G-vector shells 0.09 Mb ( 12270) Largest temporary arrays est. size (Mb) dimensions Auxiliary wavefunctions 12.68 Mb ( 962, 864) Each subspace H/S matrix 0.71 Mb ( 216, 216) Each matrix 3.01 Mb ( 456, 2, 216) Arrays for rho mixing 4.50 Mb ( 36864, 8) Initial potential from superposition of free atoms starting charge 179.99891, renormalised to 180.00000 Starting wfc are 252 randomized atomic wfcs total cpu time spent up to now is 15.7 secs per-process dynamical memory: 4.2 Mb Self-consistent Calculation iteration # 1 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 1.00E-02, avg # of iterations = 3.0 total cpu time spent up to now is 48.7 secs total energy = -1084.29782103 Ry Harris-Foulkes estimate = -1089.15157052 Ry estimated scf accuracy < 6.17058332 Ry iteration # 2 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 3.43E-03, avg # of iterations = 4.5 total cpu time spent up to now is 104.2 secs total energy = -1082.79181385 Ry Harris-Foulkes estimate = -1092.00579054 Ry estimated scf accuracy < 25.22945110 Ry iteration # 3 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 3.43E-03, avg # of iterations = 3.3 total cpu time spent up to now is 149.3 secs total energy = -1087.80672962 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.48575761 Ry estimated scf accuracy < 2.14692086 Ry iteration # 4 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 1.19E-03, avg # of iterations = 2.0 total cpu time spent up to now is 177.0 secs total energy = -1087.95805503 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.02220709 Ry estimated scf accuracy < 0.30128999 Ry iteration # 5 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 1.67E-04, avg # of iterations = 5.1 total cpu time spent up to now is 224.1 secs total energy = -1088.00285732 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.03592756 Ry estimated scf accuracy < 0.12349806 Ry iteration # 6 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 6.86E-05, avg # of iterations = 1.6 total cpu time spent up to now is 251.2 secs total energy = -1087.99572149 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.01392782 Ry estimated scf accuracy < 0.04643113 Ry iteration # 7 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 2.58E-05, avg # of iterations = 6.7 total cpu time spent up to now is 304.3 secs total energy = -1088.00486942 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.00863414 Ry estimated scf accuracy < 0.01099891 Ry iteration # 8 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 6.11E-06, avg # of iterations = 3.0 total cpu time spent up to now is 334.8 secs total energy = -1088.00525641 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.00664281 Ry estimated scf accuracy < 0.00370987 Ry iteration # 9 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 2.06E-06, avg # of iterations = 5.2 total cpu time spent up to now is 387.5 secs total energy = -1088.00650556 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.00676453 Ry estimated scf accuracy < 0.00074881 Ry iteration # 10 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 4.16E-07, avg # of iterations = 3.1 total cpu time spent up to now is 418.4 secs total energy = -1088.00657417 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.00663729 Ry estimated scf accuracy < 0.00021443 Ry iteration # 11 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 1.19E-07, avg # of iterations = 3.4 total cpu time spent up to now is 454.1 secs total energy = -1088.00661291 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.00662146 Ry estimated scf accuracy < 0.00001995 Ry iteration # 12 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 1.11E-08, avg # of iterations = 4.0 total cpu time spent up to now is 504.7 secs total energy = -1088.00662103 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.00662263 Ry estimated scf accuracy < 0.00000312 Ry iteration # 13 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 1.73E-09, avg # of iterations = 3.9 total cpu time spent up to now is 548.7 secs total energy = -1088.00662166 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.00662287 Ry estimated scf accuracy < 0.00000327 Ry iteration # 14 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 1.73E-09, avg # of iterations = 3.3 total cpu time spent up to now is 580.1 secs total energy = -1088.00662218 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.00662227 Ry estimated scf accuracy < 0.00000020 Ry iteration # 15 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 1.13E-10, avg # of iterations = 4.0 total cpu time spent up to now is 630.9 secs total energy = -1088.00662229 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.00662232 Ry estimated scf accuracy < 0.00000006 Ry iteration # 16 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 3.50E-11, avg # of iterations = 3.0 total cpu time spent up to now is 660.9 secs total energy = -1088.00662230 Ry Harris-Foulkes estimate = -1088.00662231 Ry estimated scf accuracy < 0.00000002 Ry iteration # 17 ecut= 47.00 Ry beta=0.70 Davidson diagonalization with overlap ethr = 8.52E-12, avg # of iterations = 3.0 total cpu time spent up to now is 700.7 secs End of self-consistent calculation k = 0.0000 0.0000 0.0000 ( 17071 PWs) bands (ev): -15.4892 -15.4892 -15.3656 -15.3656 -14.4911 -14.4911 -14.4868 -14.4868 -12.7202 -12.7202 -12.6920 -12.6920 -12.3084 -12.3084 -12.2478 -12.2478 -12.2317 -12.2317 -12.1529 -12.1529 -7.5870 -7.5870 -7.2622 -7.2622 -7.0444 -7.0444 -6.7857 -6.7857 -6.0031 -6.0031 -5.6572 -5.6572 -4.3366 -4.3366 -4.2390 -4.2390 -1.9107 -1.9107 -1.8638 -1.8638 -1.6645 -1.6645 -1.4641 -1.4641 -1.3849 -1.3849 -1.2264 -1.2264 -1.1790 -1.1790 -1.1222 -1.1222 -1.0988 -1.0988 -1.0399 -1.0399 -0.9935 -0.9935 -0.8996 -0.8996 -0.8690 -0.8690 -0.6266 -0.6266 -0.5954 -0.5954 -0.5600 -0.5600 -0.4364 -0.4364 -0.2106 -0.2106 -0.0783 -0.0783 -0.0778 -0.0778 0.0510 0.0510 0.1577 0.1577 0.2516 0.2516 0.3579 0.3579 0.3623 0.3623 0.4985 0.4985 0.4985 0.4985 0.5925 0.5925 0.6494 0.6494 0.7316 0.7316 0.7711 0.7711 0.8160 0.8160 0.8848 0.8848 0.8985 0.8985 0.9241 0.9241 1.0354 1.0354 1.1807 1.1807 1.2330 1.2330 1.2776 1.2776 1.4038 1.4038 1.7223 1.7223 1.7942 1.7942 2.0995 2.0995 2.2440 2.2440 2.3695 2.3695 2.6433 2.6433 2.8562 2.8562 2.8642 2.8642 2.9506 2.9506 3.1533 3.1533 3.3654 3.3654 3.4487 3.4487 3.5387 3.5387 3.5603 3.5603 3.6964 3.6964 3.8495 3.8495 3.9895 3.9895 4.0242 4.0242 4.1054 4.1054 4.1208 4.1208 4.1841 4.1841 4.3300 4.3300 4.3591 4.3591 4.4544 4.4544 4.5233 4.5233 4.5669 4.5669 4.6058 4.6058 4.8296 4.8296 4.8569 4.8569 5.1364 5.1364 5.1633 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11.1173 11.2647 11.2647 11.3544 11.3544 11.5086 11.5086 11.7242 11.7242 occupation numbers 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 1.0000 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(-TS) = 0.00000000 Ry convergence has been achieved in 17 iterations Writing output data file Hg3Se4O5.save init_run : 19.06s CPU 13.63s WALL ( 1 calls) electrons : 893.86s CPU 685.13s WALL ( 1 calls) Called by init_run: wfcinit : 15.24s CPU 10.70s WALL ( 1 calls) potinit : 0.70s CPU 0.65s WALL ( 1 calls) Called by electrons: c_bands : 690.62s CPU 576.56s WALL ( 17 calls) sum_band : 187.50s CPU 98.98s WALL ( 17 calls) v_of_rho : 1.05s CPU 0.54s WALL ( 18 calls) v_h : 0.10s CPU 0.04s WALL ( 18 calls) v_xc : 0.95s CPU 0.50s WALL ( 18 calls) newd : 14.06s CPU 8.73s WALL ( 18 calls) mix_rho : 0.72s CPU 0.37s WALL ( 17 calls) Called by c_bands: init_us_2 : 3.00s CPU 1.57s WALL ( 665 calls) cegterg : 659.41s CPU 560.08s WALL ( 323 calls) Called by sum_band: sum_band:bec : 11.46s CPU 5.82s WALL ( 323 calls) addusdens : 10.13s CPU 6.83s WALL ( 17 calls) Called by *egterg: h_psi : 384.50s CPU 286.66s WALL ( 1521 calls) s_psi : 36.41s CPU 36.35s WALL ( 1521 calls) g_psi : 0.75s CPU 0.90s WALL ( 1179 calls) cdiaghg : 145.26s CPU 147.35s WALL ( 1502 calls) cegterg:over : 35.66s CPU 35.54s WALL ( 1179 calls) cegterg:upda : 29.57s CPU 29.84s WALL ( 1179 calls) cegterg:last : 11.25s CPU 11.22s WALL ( 323 calls) cdiaghg:chol : 9.66s CPU 9.94s WALL ( 1502 calls) cdiaghg:inve : 7.49s CPU 7.46s WALL ( 1502 calls) cdiaghg:para : 14.13s CPU 14.44s WALL ( 3004 calls) Called by h_psi: h_psi:vloc : 311.30s CPU 215.65s WALL ( 1521 calls) h_psi:vnl : 69.84s CPU 68.48s WALL ( 1521 calls) add_vuspsi : 32.77s CPU 32.81s WALL ( 1521 calls) General routines calbec : 71.76s CPU 53.29s WALL ( 1844 calls) fft : 2.84s CPU 1.46s WALL ( 542 calls) ffts : 0.23s CPU 0.15s WALL ( 140 calls) fftw : 366.14s CPU 236.67s WALL ( 906384 calls) interpolate : 0.86s CPU 0.47s WALL ( 140 calls) Parallel routines fft_scatter : 130.61s CPU 94.43s WALL ( 907066 calls) PWSCF : 15m24.50s CPU 11m59.33s WALL This run was terminated on: 0:47:45 4Aug2017 =------------------------------------------------------------------------------= JOB DONE. =------------------------------------------------------------------------------=